ภายหลังที่ประชุมคณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ (ป.ป.ช.) เมื่อวันที่ 8 มี.ค. 2566 มีมติเอกฉันท์ยื่นฟ้องคดีจัดซื้อเครื่องตรวจวัตถุระเบิด และสารเสพติด GT200 และ Alpha 6 ในส่วนของสถาบันนิติวิทยาศาสตร์ จำนวน 4 สัญญา โดย พญ.คุณหญิงพรทิพย์ โรจนสุนันท์ สมาชิกวุฒิสภา ในฐานะอดีตผู้อำนวยการสถาบันวิทยาศาสตร์ ถูกชี้มูลกระทำความผิดทางอาญาด้วย

ล่าสุดเมื่อวันที่ 10 มีนาคม  พญ.คุณหญิงพรทิพย์ โรจนสุนันท์ ส.ว. ในฐานะอดีตผู้อำนวยการสถาบันนิติวิทยาศาสตร์ กระทรวงยุติธรรม ให้สัมภาษณ์ผ่านรายการเจาะลึกทั่วไทย อินไซด์ไทยแลนด์ ต่อกรณีที่คณะกรรมการป้องกันและปราบปรามการทุจริตแห่งชาติ (ป.ป.ช.) ชุดใหญ่มีติเอกฉันท์สั่งฟ้องในคดีจัดซื้อเครื่องตรวจวัตถุระเบิดและสารเสพติด GT200 และ Alpha6 ว่า คิดอยู่แล้วว่าป.ป.ช.จะฟ้อง เพราะปี 2553 มีประเด็นเกี่ยวข้องกับการเมือง เราโดนถล่มมากและต้องหาใครมาลงโทษ แต่เรื่องนี้ยืนยันว่าตนไม่ได้ทุจริตแน่นอน แต่ไม่รู้ว่าจะต่อสู้ได้หรือไม่ เพราะมีคนอยู่เบื้องหลังและต้องการจัดการตน ซึ่งตนรู้ว่าเป็นใคร เพราะเคยเจออารมณ์นี้กับบุคคลนี้ตอนเสนอร่างพระราชบัญญัตินิติวิทยาศาสตร์ โดยพล.อ.ไพบูลย์ คุ้มฉายา รมว.กระทรวงยุติธรรมขณะนั้นเสนอสภาฯ ในปี 2558 โดยพบว่าโดนขัดขวางจาก สมาชิกสภานิติบัญญัติแห่งชาติ (สนช.) ลุกขึ้นกล่าวหาให้ร้ายและปัจจุบันบุคคลนี้ก็อยู่ในวง ป.ป.ช. ดังนั้นพอจะรู้ว่า รอดยาก

พญ.คุณหญิง พรทิพย์ กล่าวด้วยว่า กรณีของ ป.ป.ช. ที่สั่งฟ้องตนนั้น ถือว่าไม่ได้ให้ความธรรม ใน 2 ประเด็น คือ ความล่าช้าและไม่เปิดโอกาสให้ชี้แจง และในการตัดสิน เราไม่ทราบว่าใช้อะไรในการตัดสิน